Endüstriyel Biyoteknoloji alanında, mikroorganizma temelli olarak bitki, hayvan, …vb birçok canlının mikroorganizma çalışmaları gerçekleştirebilmekte ve bu sayede farklı kaynaklardan mikroorganizma izolasyonları gerçekleştirilmektedir.

Endüstriyel Biyoteknoloji sayesinde mikroorganizma temelli biyoteknolojik değeri olan protein, enzim veya diğer hücresel ürünler fermentasyon teknolojisi yardımıyla kolay üretilebilmektedir.

Endüstriyel Biyoteknoloji çalışmalarıyla farklı ticari kullanım alanına ve önemine sahip enzimlerin başarıyla üretim koşulları oluşturulmaktadır.

Endüstriyel Biyoteknoloji çalışmalarıyla, tek hücre protein (THP) teknolojisini içeren mikroorganizmalar yardımıyla farklı metabolitlerin üretimini sağlar.

Endüstriyel Biyoteknoloji uygulamaları sayesinde biyotransformasyon tekniği yardımıyla mikroorganizmaların çevresel açıdan önemli geri dönüşüm süreçlerinde yer alması konusunda çalışmalar yürütülmektedir.

Endüstriyel Biyoteknolojide toprak, su ve hava mikrobiyolojisinin tanınması ve bu ortamlardaki bakteriyel kirlilik unsurlarının tespitine yönelik çalışmalar yapılmaktadır. Bu çalışmalara göre mikrobiyal kirlilikten kaynaklanan sağlık tehlikeleri ve mücadele yöntemleri hakkında toplumu eğitmektedir.